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        <journal-title>医学研究</journal-title>
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      <issn>2661-359X</issn>
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        <publisher-name>华文科学出版社</publisher-name>
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      <article-id pub-id-type="doi">10.12421/yxyj2661-3603-2025-7-6-227</article-id>
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        <article-title>轻量化组学数据在医学生物信息学教学中的探索</article-title>
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          <string-name>汪露 (三峡大学基础医学院 湖北宜昌 443002)</string-name>
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        <year>2025</year>
        <month>6</month>
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      <issue>6</issue>
      <abstract>
        <p>高通量组学数据庞大，数据分析流程复杂，因而在硬件资源有限的课堂教学环境中只能进行多媒体演示，导致课堂与实践严重脱节。 为解决这一难题，本研究利用生成式 AI 大模型协助本地开发的 python 脚本模拟生成涵盖 RNA-Seq、单细胞测序及宏基因组测序等领域的 轻量化组学数据，将数据量压缩至原始数据的 4.1% ~ 9.9%。经标准化分后，生成的轻量化组学数据在 RNA-Seq、单细胞测序及宏基因组测 序标准化分析任务的平均耗时分别缩短至原数据处理时间的 19.4%（73.7 ± 4.0vs 377.5 ± 10.1 分钟）、4.5%（83.1 ± 1.4vs 1866.7± 75.4 分钟）和 10.4%（77.4 ± 1.2 vs 743.4 ± 9.8 分钟）；存储资源分别减少至原始数据的 9.2%、5.0%和 4.7%；内存峰值分别降低至原始数据 的 7.7%、18.4%和 22.6%。这些结果表明，生成的轻量化组学数据能够支持在 90 分钟的课堂内完成全流程分析实践。因此，本研究构建了 一个计算资源需求、时间与教学目标之间的动态适配机制，为医学生物信息学课堂教学提供了可扩展且高效的解决方案。</p>
      </abstract>
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