随着“三全育人”综合改革的深入推进，新型的网络空间已成为高校思想政治教育的主要阵地之一。而高校辅导员作为大学生思想政治教育的实施主体，在教育的过程中面临着前所未有的机遇和挑战。本文旨在“三全育人”理念下，分析网络思想政治教育在主体、过程、载体三个方面的困境，即“全员”协同困境、“全过程”衔接困境、“全方位”融合困境。根据以上三个方面的困境，文章构建了高校辅导员开展网络思想政治教育的实践路径：一是聚焦“全员”合力，构建协同化网络育人共同体；二是贯通“全过程”链条，打造阶梯化内容体系；三是整合“全方位”资源，搭建立体化传播矩阵。这些实践路径的研究，为高校辅导员提供了理论支持及实践经验。