目的：对部队队属医院与大型医院感染防控工作的不同之处进行比较分析，为提升军队医疗机构院感防控水平、平战时卫勤保障能力提供理论依据。方法：梳理军队医院感染防控相关研究文献与实践经验，采用比较研究法，从组织架构、人才培训、资源配置、感控实践等对两类医院院感工作现状进行系统性的比较研究。结果：部队大型医院院感管理体系完善、资源充足、感控专职人员专业化程度高；队属医院配备感控专职人员，但存在管理支撑不足、人员专业能力薄弱、硬件资源匮乏、信息化滞后等问题，两类医院院感防控水平差距较大，且都存在投入产出张力下感控工作的成本安全悖论、野战卫勤条件下感控能力有待提高的困境。结论：构建差异化标准、网络化协同、实战化转型的整合，完善平战结合的院感防控体系，是提升军队医院整体感控效能的关键。